长期以来，家猫何时来到中国、家犬如何随人类迁徙、家鹅的起源、东亚家牛是否单一起源等问题，不仅引发公众兴趣，更关乎农业起源、交通贸易、人口流动和文化交流的研究。传统研究主要依靠形态学鉴定和遗址出土资料，但在跨区域传播、杂交和共生关系等复杂问题上，往往难以给出准确的时间和清晰的谱系。分子考古的发展为这些未解之谜提供了新的证据和解释框架。
动物考古学正成为理解人类文明发展的重要窗口。从豹猫到家猫的5000年共生史到家犬的万年迁移路线，从家鹅的灰雁起源到家牛的多元融合，这些发现共同表明：人类文明发展始终在与周边地区和民族的交流中进行。分子考古等新方法让我们能以更科学、精准的方式解读历史。未来，随着研究的深入，动物考古学必将在揭示中华文明的多元一体特征、阐释跨区域文明互鉴中发挥更大作用。