1983年5月李良辉成了空降兵军长，那会儿他才30多岁，是最年轻的。他觉得当兵就得实战，对了，在那次华北演习里，他带着部队跳伞落地后马上集结去支援别人，连后勤人员都得学会跳伞。他还带队去神农架穿越丛林，带很少的东西坚持几天，这就为了培养官兵的毅力。 后来他和政委在管理上意见不合，沟通不好。1987年初政委调走了，总政治部调查后觉得是他俩配合出了问题。军委就把他空降兵军长的职务免了，让他去国防大学进修。1988年恢复军衔时，他只给了个大校衔。 进修到1989年7月毕业，他穿便装过了一阵日子。1990年6月他调到宁夏军区当了副司令员。李良辉在宁夏还挺忙的，组织武装部长集训、早操风雨无阻、还把原来的伞降队伍调过来示范表演，激发了大家的热情。1993年他又升为宁夏军区司令员了。 这时候他又去国防大学学边防知识了，回来后调整高原演练的内容。1997年3月李良辉到了新疆军区当司令员，是副大军区级的官儿。到了新疆他加强边防巡查，后来还获了中将军衔。1999年军区搞阅兵的时候大家表现都不错。 2000年9月8日乌鲁木齐西山路出了个大事故，一辆运报废弹药的军车爆炸了，伤亡惨重。调查说是运输预案没做好检查也不严实。李良辉把辞职报告递上去了，军委批准了他的辞职请求。 金一南在国防大学的时候写过文章，他说李良辉回答北京青年报问卷时说“一时冲动唤起满腔热血”这句话很打动人。他觉得军人没热血撑着就不算合格。 李良辉两次被免职但还是没离开军队这条道儿。2001年1月他到了济南军区当副司令员。这时候他还批评过陪同人员讲不当的话。退休后他就不再公开露面了。 不管职位怎么变他心里始终装着军队。