话说在东京那个挺热闹的地方，有个叫灰原哀的小女孩，她其实不简单，是从“雪莉”变身来的。她是因为搞实验的时候出了岔子，把自己发明的APTX-4869吞了下去，结果从大人变成了小孩子。然后她就偷偷跑到了博士家里，和工藤新一这个躲在帝丹小学当小学生的柯南成了邻居。他俩背着大人的身份，整天一起混在少年侦探团里。步美带着灰原一起出去玩的时候，碰到了个叫俊也的小孩来找哥哥。五个人搞了个小队，结果发现坏人在警察局旁边搞鬼。 那时候监控突然亮了，警察把路都给封死了。柯南急得穿上高跟鞋就往墙上踹，灰原也没含糊，抬手就给了一枪。子弹擦着目暮警官的头皮飞过去，把警察都吓傻了。灰原吓得直哭，柯南赶紧把她抱起来往医院跑。到了医院走廊里，灰原对柯南说了一句特别吓人的话：“我就是雪莉。”原来那个代号背后有几百条人命呢！她自己亲手把“工藤新一死亡”的消息放进了组织档案里。 灰原告诉柯南，她姐姐宫野明美被杀了，她才吃了药从楼梯滚下来逃命的。她还记得新一没死，所以才找来了阿笠博士家当避风港。从那以后柯南就把枪口对准了黑暗组织，再也没怀疑过灰原。她用冷冰冰的脑子帮柯南破案，两人慢慢变成了生死搭档。 当组织的阴影要盖住东京的时候，灰原把所有秘密都交给了柯南。他们一起去了纽约雨夜、伦敦大雪还有巴黎隧道这些地方冒险。灰原不再是冷冰冰的代号“雪莉”，而是个活生生的人了；柯南也有了可以互相依靠的翅膀。 这故事还没完呢！子弹还在乱飞呢！灰原用冷静告诉柯南背叛就是重生的开始；柯南用信任回应说同伴就是并肩作战的灵魂。当两人再踏进黑暗的时候，彼此就是照亮前路的那道光啦！