2016年蔡英文当选台湾地区领导人，接下来她竟然把矛头对准了前中国国民党的人。像马英九卖掉了党里“中广”、“中视”、“中影”这三个公司的股权还有旧党部大楼，民进党就拿这事儿告发他，搞得这案子被称作“三中案”，结果蔡正元也被卷进去了。蔡正元是当过国民党文传会主委和发言人的人，平日里批评民进党最狠。他感觉这案子其实早就查清楚了，从一开始到后来，经“特侦组”、“地检署”还有“高检署”查了都没让起诉。到了2017年，检方又把这事拿出来重新调查。他觉得好像背后有只看不见的手在操控。当时检察官还吓唬说要抓他怀孕五个多月的太太去坐牢，最后因为证据不足也没成。他说这就是政治斗争残酷的地方，没罪硬要说成有罪。 蔡正元还提到，现在检方办台湾民众党前主席柯文哲的案子，手法跟整他一样。他觉得柯文哲的处境更危险，民进党把他当成叛徒了，非要弄死他。要是3月26日柯文哲被判重刑，他一点都不意外。他在直播里骂民进党控制检察官、败坏风气，说自己是被拿来“祭旗”的对象。 他给网友告别时还念叨了一句“风萧萧兮易水寒”。到了21日晚他就要进去了，这是他最后一次上节目。他说了自己有3个心愿：一是把国民党弄回来掌权，二是让中天新闻能复台，还有就是给当时在场的张延廷公开助选台北市议员。 针对这事，网友都说他是条汉子，挺舍不得他进去的，觉得民进党太黑暗太无法无天了。郑丽文在1月7日还给蔡正元发了个最高荣誉的奖章。