1960年，阎又文被调到了农业部粮油局做了局长。这个时期正好碰上了三年自然灾害，事情挺多也挺难办，累得他够呛。1962年9月，他积劳成疾，年仅48岁就走了。他死的时候排场不小，周总理亲自给写了挽联，《人民日报》也发了讣告，农业部还给他写了碑文。大家都觉得这人肯定是做了什么了不得的大好事。可是没过多久，他老婆孩子想通过政审就总被卡住。问为什么吧，就一句“历史问题不清楚”，这事儿一搁就是三十多年。 直到1993年，谜底才终于被揭开。原来阎又文不光是个革命功臣，还是个红色间谍。他以前为了照顾上司傅作义的情绪，做了个艰难的决定，结果连累了家里人。新中国成立后他还在水利部农田部水利局当过副局长，后来调回农业部也是那阵子。那时候组织一直没把他间谍的身份公开，怕傅作义接受不了。他自己心里也清楚，就一直忍着没说。 1962年去世的事成了阎又文一生中的大转折。那个时候正是那个艰难的年头，阎又文因为劳累过度才走的。去世以后他的功劳就被埋在了历史的尘土里。过了几十年后，跟他单线联系的王玉才才把他的故事讲了出来。可这时候啊，时间已经太晚了。